引发辣椒死棵的因素主要是土传病害，其中包括立枯病、猝倒病、疫病、茎基腐病、根腐病、枯萎病、青枯病等，主要有卵菌、半知菌、子囊菌、细菌引起，不同病菌引起的病害症状虽然不同，但共同的特点就是以土壤为载体进行繁殖和传播，如何土壤消毒和湿度管理是防治辣椒死棵的主要技术手段。
真正要解决死棵问题，建议还是从以下四个方面着手。
一、改良土壤，解决盐渍化问题。
引起辣椒死棵的病菌是土传病菌，说明这些有害菌大部分是厌氧菌。通过深翻耕地，增施有机质，增加土壤透气性，形成一个不利于病菌繁殖和侵染的环境至关重要。本身土壤板结，积水严重，根系呼吸困难，要想不感染病害是很难的，解决这个问题可以施足作物秸秆稻壳粪等，坚持数年，必有好处，施用前注意要充分发酵腐熟。
二、重视无病苗木的选择
建议选用品牌种苗和工厂化育苗，一般说工厂化育苗操作规范严格。不是家庭作坊式育苗能比的，不提倡为了节省成本自己用田园土育苗。
三、以菌抑菌，减少农药的使用量。
酵素菌、多种芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌、木霉菌、EM菌等许多有益微生物，强大到足以拮抗有害菌的侵染时，才能对死棵发挥作用，生物菌肥的施用一是数量要足，二是施用后注意尽量避免强光暴晒，应立即深翻入土壤，三是切忌与杀菌剂混用，四是使用甜如蜜-伊克茬 专利技术，牛奶发酵菌液，专业高抗重茬、分解毒素，抗低温冷害，松土发根。
四、化学防治的必要性和技术要点。
实践证明，在合理施用菌肥的基础上，使用化学药剂配方进行辣椒死棵的防治。具有效果好、时间短、成本低、简便易行的优势。